Quatre ans plus tard, TK et KARI qui ont grandi et doivent, à la place de TAI, mener les digisauveurs dans leurs tâches.
En effet, un nouvel ennemi, Ken alias l'empereur DIGIMON, veut conquérir les deux mondes. Pour arriver à ses fins, il utilise des objets maléfique comme le black digivice, les anneau maléfiques et les spirales maléfiques pour ensorceler les digimons. Les trois autres nouveaux DIGISAUVEURS sont sélectionnés, DAVIS, désigné comme leader, YOLEI et CODY. Ensemble, ils rouvrent le portail vers le monde DIGITAL pour combattre les forces obscures. Ensemble, ils luttent contre ce nouveau ennemi dont ils n'en connaissent que peu et percer le mystère de cet enfant au coeur démoniaque. Les enfants réaliseront au fur et à mesure que la quête qui leur est confiée s'avère nettement plus compliquée qu'ils le croyaient et que KEN ne constitue qu'un digisauveur de plus qu'ils devraient convaincre de rejoindre leur cause pour la véritable épreuve qui leur attend : sauver une fois de plus les mondes à travers des monstres toujours plus puissants.