En décembre 1989, soucieux du niveau du faible niveau niveau des tambours jurassiens, Philippe Moirandat de Alle et Christian Kobel de Porrentruy se lancent le défi de former une société de tambours.

Ce n'est pas moins de 25 personnes qui répondent à l'appel. C'est par un petit concours que la majorité des membres donne le nom de "La Baguette d'Ajoie" au groupe.

Philippe Moirandat prendra la présidence et sera chargé de mettre en place avec l'aide du comité les structures nécessaires à la seule société de tambours du Jura. Les deux premières années seront consacrées à la mise à niveau des différents tambours et à l'élaboration d'un répertoire musical.

En 1992, Eric Jolidon prend la présidence de la Baguette à laquelle il donnera un souffle de jeunesse. C'est en 1994, que Georges Desboeufs reprendra le flambeau. Il aura marqué la société par son savoir faire et son sens de l'initiative. C'est à ce moment que le groupe prendra véritablement son envol.

En 1995, la société se dote d'un nouvel uniforme, une manifestation réunissant les parents et amis de la Baguette a fêté dignement ce nouvel habillement.

En 1998, pour des raisons de santé, Georges Desboeufs cède la présidence à Walter Amstutz de Mormont qui aura pour mission première de mettre en place les festivités du 10ème anniversaire.

En Septembre 2000, la société fête en grande pompe sur deux jours son 10ème anniversaire en compagnie de Glen of Guinness, Les Fifres et Tambours Sierrois, Reflets d'Ajoie et les Récidivistes.

Au fil des années, La Baguette d'Ajoie ne cesse de se développer. Sous la direction de Philippe Moirandat, la société participe à de nombreux concours tant cantonaux que fédéraux, avec à chaque fois des résultats très honorables . En outre, elle anime différentes manifestations comme par exemple des carnavals (Bassecourt, Mulhouse, Delle, Alle, etc.), la Braderie Bruntrutaine, Fête de village, etc.

Actuellement la société est très sollicitée, aussi bien dans la région qu'à l'extérieur des frontières jurassiennes. Ceci est principalement dû à la richesse du programme musical de la société. En effet le groupe joue aussi bien des morceaux de tambours que de percussions qui à chaque fois mettent une ambiance de tonnerre.

La société qui s'abstient de toute tendance politique, est composée d'une vingtaine de tambours divisées en 2 groupes, avancés et débutants. Le jour de répétition est le lundi soir à Alle.