CV de Marilyn ZAGO

Pour télécharger le CV au format PDF cliquer ici

                                    - Marilyn ZAGO -                                 

 

 

Coordonnées

Email : zago(at)lumimath.univ-mrs.fr

Formation

2003-2004 : Obtention du DEA d'Informatique avec la mention Assez Bien - Filière Info Bio Maths - Ecole doctorale de Mathématiques et d'Informatique de Marseille - Université de la Méditerranée (Marseille 2) - Faculté des Sciences de Luminy - Département d'Informatique de Luminy.

 

2002-2003 : Obtention du DESS Mathématiques Informatique des Nouvelles Technologies avec Mention Très Bien - Major de promotion - Université de la Méditerranée (Marseille 2) - Faculté des Sciences de Luminy - Département de Mathématiques.

 

2001-2002 : Obtention de la Maîtrise d'Informatique avec mention Assez Bien - Faculté des Sciences de Luminy - Université de la Méditerranée (Marseille 2).

 

2000-2001 : Maîtrise  Génie Mathématique et Informatique  et Obtention du titre d'ingénieur maître -  Institut Universitaire Professionnalisé  Mathématiques Appliquées et Industrielles » - UFR IMA - Université Grenoble1.  


1999-2000 : Licence  Génie Mathématique et Informatique  -  Institut Universitaire Professionnalisé  Mathématiques Appliquées et Industrielles » - UFR IMA - Université Grenoble1.

 

1998-1999 : DEUG  Génie Mathématique et Informatique  -  Institut Universitaire Professionnalisé  Mathématiques Appliquées et Industrielles » - UFR IMA - Université Grenoble1.

 

1997-1998 : 1° année de DEUG Mathématiques Informatique et Application aux Sciences à l’Université d’Avignon et Pays de Vaucluse (mention A-Bien).
 

Juin 1996 : Baccalauréat Scientifique Spécialité Sciences de la Vie et de la Terre 

Lycée Polyvalent René Char – Avignon.  

 

Compétences en Mathématiques Appliquées 

 

- Statistiques : Analyse de données, Classification, Modélisation paramétrique et non paramétrique, Séries temporelles, Prévision, Data-mining,  statistique inférentielle, files d'attente et processus stochastiques

- BioInformatique : algorithmes d’analyses de séquences, analyse de données biologiques, modèles pour les réseaux génétiques, classification et phylogénie, bases de données biologiques, fouille de données …

- Modélisation géométrique : Modélisations de type B-REP et CSG, modélisation par éléments de volumes, courbes et surfaces de formes libres)

- Optimisation  : Optimisation discrète et continue, recherche opérationnelle, optimisation dans les réseaux. Utilisation du logiciel XPress Mosel pour la modélisation et la résolution de problèmes d'optimisation

- Traitement du signal et de l’image : analyse d’images et reconnaissances de formes, imagerie médicale, analyse spectrale

- Cryptographie : codes correcteurs d’erreur, complexité des algorithmes

                                       

                                       

 

Compétences informatiques 

 

- Programmation en langage Pascal et C.

- Programmation orientée objet en langages Java, C++, Visual Basic 6.0

- Programmation en Prolog . Programmation logique (logique propositionnelle et du premier ordre).

- Bases de données relationnelles :

             Programmation en PL/SQL.

             SGBD Oracle

             Méthode Merise.

- Programmation sur machines parallèles . Utilisation de la bibliothèque MPI.  

- Logiciels scientifiques : Minitab (traitement statistique) , Maple , Matlab , Mathcad, Mosel, SAS, R

- Notions de HTML et création de pages WEB

- Bureautique : Word , Excel , Powerpoint

Langues

 

Anglais : Lu, écrit, parlé

Allemand : Notions scolaires

Stages professionnels et projets

Année 2003-2004 : Mémoire de DEA

  Encadré par Badih Ghattas - Institut de Mathématiques de Luminy - Equipe Modélisation Mathématique pour le Génome

Les réseaux bayésiens, application à la Bioinformatique

Sujet

Les réseaux bayésiens (RB) constituent un outil puissant pour la modélisation les dépendances entre différentes variables observées dans un système. Il s'agit de techniques à cheval sur la théorie des graphes et celle des probabilités.

Les nœuds du graphe recherché représente les différentes variables d’intérêt. Les arcs caractérisent des dépendances conditionnelles entre les variables. La construction d’un RB nécessite l’optimisation d’une structure (celle du graphe) et le calcul de probabilités conditionnelles.

Les RB ont bénéficié d’un succès considérable en BioInformatique essentiellement pour la modélisation d’interaction entre gênes ou entre protéines. Cette modélisation utilise les données d’expression.

La difficulté principale dans ce contexte vient du nombre de nœud constituant le graphe à construire. Des travaux récents  ont suggéré des algorithmes permettant l’accélération de la procédure d’optimisation.

Une variante des RB consiste à analyser des données qui évoluent dans le temps, il s’agit des RB dynamiques. Ce type de modèles est en cours d’étude, les procédures proposées pour leur mise en œuvre sont trop « lourdes ».

 

            L’objectif de ce travail est le suivant :

-                             Etudier les algorithmes d’optimisation des structures des RB quand on dispose d’un grand nombre de variables (~quelques milliers de nœuds)

-                             Proposer une procédure basé sur du « Clustering » permettant de réduire le nombre de nœuds utilisés dans le graphe.

-                             Appliquer ces techniques à des données réelles fournies par le LGPD

-                             Faire l’état des lieux de l’approche dynamique.

 

31 Mars 2003 - 30 Septembre 2003 :  

    Centre d'IRM Fonctionnelle Cérébrale de Marseille  - Hôpital de la Timone - Site web : http://irmfmrs.free.fr

    Traitement de données physiologiques dans le cadre de l'imagerie fonctionnelle cérébrale : développement de logiciels prenant en compte les   données physiologiques du sujet pour le traitement des données IRMf.

 

Janvier – Mars 2003 :

    Gemplus (Gemenos – Bouches du Rhône) / Université de la Méditerranée

Mémoire de DESS effectué en collaboration avec la société Gemplus. Etude de techniques de recommandation de films pour la télévision interactive.

 

02 Mai 2002 - 30 Juillet 2002 :  

    Institut National de la Recherche Agronomique – Centre de recherches d’Avignon – Site web : http://www.avignon.inra.fr

    Stagiaire au sein de l’équipe télédétection de l’unité "Climat Sol Environnement" .

    Développement d’une application Matlab pour faire de la correction géométrique d'images

 

01 Avril - 30 Septembre 2001 :  

    Thalès Microsonics formerly Thomson Microsonics – Site de Valbonne - Sophia Antipolis  (06) – Site web : http://www.thalesgroup.com

    Stagiaire au sein du Service Recherche Design et Simulation (SRDS)

    Sujet du stage : Calcul et visualisation d'isocourbes en Visual Basic 6.0 . Intégration dans l'environnement de  Design.

    Logiciels utilisés : Mathcad, Visual Basic 6.0, Microsoft Help Workshop, Compaq Visual Fortran.

 

01 Juin - 30 Août 2000 :  

    Institut National de la Recherche Agronomique – Centre de recherches d’Avignon –  Site web : http://www.avignon.inra.fr

    Stagiaire au sein de l’équipe télédétection de l’unité de bioclimatologie .

    Développement d’une application Matlab pour l’évaluation de la surface de sol couverte par la végétation à partir de photographies hémisphériques numériques.

    Programmation sous Matlab et en langage C++  

 

Août 1999 :  Customer Contact - Avignon

    - Traitement d'enquêtes sous Ethnos sur la qualité des opérateurs de cartes téléphoniques prépayées

    - Création de tableaux sous Excel pour le suivi des opérations de téléprospection.

Expérience professionnelle

 Secteur bancaire

Août 1998 : Auxiliaire de vacances au Crédit Lyonnais (Agence de Tarascon – 13) 

 

 Hôtellerie de plein air

Festivals d'Avignon 1994-1997 : Camping-Auberge BAGATELLE Avignon

                                                     -Reception du camping et de l’auberge

                                                     -Tenue des caisses du Camping et du Restaurant

                                                     -Suivi des commandes aux fournisseurs

                                                    -Inventaire , manutention

 

 Animatrice scientifique, visites guidées

Juillet - Août 1998 :Animatrice scientifique au Parc du Soleil et du Cosmos (Les Angles – 30)

 

Divers

Loisirs : Peinture sur verre, généalogie, astronomie ,  philatélie

Sports : Aviron , natation

Permis B